Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Biyoistatistik ve Tıbbi Bilişim Anabilim Dalı Öğretim Üyesi Doç. Dr. Aslı Suner Karakülah ile İzmir Biyotıp Genom (İBG) Merkezinden bir grup araştırmacı, koronavirüsün en çok mutasyona uğrayan genlerini belirledi. 6 kıtada farklı ülkelerdeki hastalardan toplanan toplam 30 bin koronavirüs genom bilgisi üzerinde yaptıkları çalışmalar hakkında EÜ Rektörü Prof. Dr. Necdet Budak’a bilgi veren Doç. Dr. Karakülah, “İstatistik ve biyoinformatik analizlerimiz sonucunda; özellikle virüsün çoğalmasından sorumlu RdRp ile Nsp14 genlerindeki ve virüsün akciğerlere tutunmasından sorumlu Spike proteininde belirli mutasyonların olduğunu belirledik” diye konuştu.
Dünyayı etkisi altına alan koronavirüs salgınında hasta sayısı her geçen gün artarken, aralarında Ege Üniversitesinin de bulunduğu bazı özel ve kamu kuruluşları aşı çalışmalarını hızla sürdürüyor. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Biyoistatistik ve Tıbbi Bilişim Anabilim Dalı Öğretim Üyesi Doç. Dr. Aslı Suner Karakülah ile İzmir Biyotıp Genom (İBG) Merkezinden bir grup araştırmacı, hem aşı çalışması yapan hem de klinik araştırmalar yürüten bilim insanlarını yakından ilgilendiren bulgulara ulaştı. Araştırma ekibi, 6 kıtada farklı ülkelerdeki hastalardan toplanan toplam 30 bin koronavirüs genom bilgisinin yer aldığı “Tüm İnfluenza Verilerinin Paylaşımı Küresel İnisiyatifi” (GISAID) verileri üzerinde yaptıkları çalışmalar sonucunda elde ettikleri bulguları, EÜ Rektörü Prof. Dr. Necdet Budak, tıp fakültesi ve hastane yönetimiyle paylaştı.
EN ÇOK MUTASYONA UĞRAYAN GENLER BULUNDU
Doç. Dr. Aslı Suner Karakülah, İBG araştırmacıları Dr. Öğretim Üyesi Yavuz Oktay, Doç. Dr. Gökhan Karakülah ve doktora öğrencisi Doğa Eskier, virüsün belirlenen değişimlerinin, virüs genleri üzerinde aynı oranda dağılmadıklarını ve virüsün bazı genlerinin diğerlerine göre daha çok değişime uğradığını belirledi. Bulgular arasında, koronavirüs genomunda zamanla biriken değişimlerin pandemi evreleri boyunca farklılık gösterdiğinin de yer aldığını söyleyen Egeli bilim insanı Doç. Dr. Karakülah, “Virüsün kendi kendisini kopyalamasında rol oynayan RdRp ve Nsp14 genleriyle akciğerlere tutunmasından sorumlu Spike proteininde gerçekleşen mutasyonlara baktık. Bu mutasyonları taşıyan virüslerde yayılım hızının daha yüksek olduğunu ve dolayısıyla bulaşıcılığının da daha fazla olabileceğini öngörüyoruz. Bu da bize, koronavirüsün değişkenliği ve muhtemel bulaşıcı etkileri üzerinde öngörüde bulunmamızı sağlıyor” dedi.
ÇALIŞMALAR SAYGIN BİLİM DERGİLERİNDE YAYINLANDI
Elde ettikleri verilerle ilgili hazırladıkları makalelerin dünyada saygın bilim dergilerinde yayınlandığını dile getiren Doç. Dr. Karakülah, “Eğer bu mutasyonları taşıyan virüsler varsa o zaman bize bulaşıcılık konusunda erken uyarı sistemi gibi uyarılar verebilecek. Hastanelerin atık sularında ya da toplu ulaşımda sürüntü yoluyla örnek alındığında burada elde edilen verilerde RdRp, Nsp14 genleriyle Spike proteinindeki mutasyon taşıyan virüsler varsa o zaman bunların bazılarının daha bulaşıcı olabileceği ve daha hızlı yayılım gösterebileceği sonucuna varabiliyoruz. Bizim elde ettiğimiz bulgular, GISAID veri tabanına Mart ayından buyana güncellenerek, dünya çapındaki araştırmacıların yüklediği genom verilerinden yola çıkarak elde ettiğimiz bulgular. Bulgularımız istatistik ve biyoinformatik analiz sonuçlarına dayanıyor. Klinik verilerin de bu bulguların içine entegre edilmesiyle mutasyonların hastalık üzerine olası etkilerinin aydınlatılabileceğini düşünüyoruz” diye konuştu.
“DAHA ETKİN TEDBİR ALINMASINA KATKI SAĞLAYACAK”
Çalışmalarından dolayı Doç. Dr. Karakülah’ı tebrik eden Rektör Budak, “Bu çalışmalar sahada araştırma yapan bilim insanlarına ışık tutacak nitelikte. Klinik araştırma yapan bilim insanları, virüsün onlarca mutasyonunu incelemek yerine, araştırma ekibinin işaret ettiği mutasyonlara yoğunlaşarak önemli ölçüde zaman kazanacak. Ayrıca, saha çalışmalarından elde edilecek sonuçlardan yola çıkılarak daha etkin önleyici tedbirler alınabilecek. Araştırma ekibini tebrik ediyorum, maddi ve manevi olarak her zaman yanlarında olduğumuzu bir kez daha vurgulamak istiyorum” dedi.
Yerel Haberci
24/04/2024
Yerel Haberci
03/04/2024
Yerel Haberci
28/03/2024
Yerel Haberci
28/03/2024
Yerel Haberci
26/03/2024
Yerel Haberci
25/03/2024
Yerel Haberci
25/03/2024
Yerel Haberci
20/03/2024
Yerel Haberci
12/03/2024
Yerel Haberci
06/03/2024
Yerel Haberci
02/03/2024
Yerel Haberci
28/02/2024
Yerel Haberci
11/02/2024
Yerel Haberci
31/01/2024
Yerel Haberci
28/01/2024
Yerel Haberci
23/01/2024
Yerel Haberci
22/01/2024
Yerel Haberci
10/01/2024
Yerel Haberci
06/01/2024
Yerel Haberci
23/12/2023
Yerel Haberci
19/12/2023
Yerel Haberci
19/12/2023
Yerel Haberci
10/12/2023
Yerel Haberci
28/11/2023
Yerel Haberci
24/11/2023
Yerel Haberci
22/11/2023
Yerel Haberci
16/11/2023
Yerel Haberci
14/11/2023
Yerel Haberci
11/11/2023
Yerel Haberci
06/11/2023
Yerel Haberci
03/11/2023
Yerel Haberci
02/11/2023
Yerel Haberci
02/11/2023
Yerel Haberci
16/10/2023
Yerel Haberci
14/10/2023
Yerel Haberci
11/10/2023
Yerel Haberci
08/10/2023
Yerel Haberci
05/10/2023
Yerel Haberci
29/09/2023
Yerel Haberci
28/09/2023
Yerel Haberci
26/09/2023
Yerel Haberci
12/09/2023
Yerel Haberci
30/08/2023
Yerel Haberci
22/08/2023
Yerel Haberci
05/08/2023
Yerel Haberci
22/07/2023
Yerel Haberci
24/07/2023
Yerel Haberci
15/07/2023
Yerel Haberci
03/07/2023
Yerel Haberci
21/06/2023
Yerel Haberci
20/06/2023
Yerel Haberci
04/06/2023
Yerel Haberci
02/05/2023
Yerel Haberci
22/04/2023
Yerel Haberci
23/03/2023
Yerel Haberci
18/03/2023
Yerel Haberci
18/03/2023
Yerel Haberci
18/03/2023
Yerel Haberci
18/03/2023
Yerel Haberci
18/03/2023
Yerel Haberci
18/03/2023
Yerel Haberci
18/03/2023
Yerel Haberci
18/03/2023
Yerel Haberci
16/03/2023
Yerel Haberci
16/03/2023
Yerel Haberci
10/03/2023
Yerel Haberci
07/03/2023
Yerel Haberci
27/02/2023
Yerel Haberci
25/02/2023
Yerel Haberci
22/02/2023
Yerel Haberci
19/02/2023
Yerel Haberci
10/02/2023
Yerel Haberci
08/02/2023
Yerel Haberci
28/01/2023
Yerel Haberci
14/01/2023
Yerel Haberci
04/01/2023
Yerel Haberci
28/12/2022
Yerel Haberci
28/12/2022
Yerel Haberci
28/12/2022
Yerel Haberci
10/12/2022
Yerel Haberci
24/11/2022
Yerel Haberci
23/11/2022
Yerel Haberci
16/11/2022
Yerel Haberci
16/11/2022
Yerel Haberci
10/11/2022
Yerel Haberci
05/11/2022
Yerel Haberci
03/11/2022
Yerel Haberci
01/11/2022
Yerel Haberci
10/10/2022
Yerel Haberci
04/10/2022
Yerel Haberci
03/10/2022
Yerel Haberci
01/10/2022
Yerel Haberci
28/09/2022
Yerel Haberci
25/09/2022
Yerel Haberci
25/09/2022
Yerel Haberci
21/09/2022
Yerel Haberci
20/09/2022
Yerel Haberci
09/09/2022
Yerel Haberci
09/09/2022
Yerel Haberci
03/09/2022
Yerel Haberci
31/08/2022
Yerel Haberci
04/08/2022
Yerel Haberci
15/07/2022
Yerel Haberci
27/06/2022
Yerel Haberci
17/06/2022
Yerel Haberci
15/06/2022
Yerel Haberci
10/06/2022
Yerel Haberci
02/06/2022
Yerel Haberci
01/06/2022
Yerel Haberci
16/05/2022
Yerel Haberci
09/05/2022
Yerel Haberci
30/04/2022
Yerel Haberci
26/04/2022
Yerel Haberci
21/04/2022
Yerel Haberci
20/04/2022
Yerel Haberci
19/04/2022
Yerel Haberci
19/04/2022
Yerel Haberci
18/04/2022
Yerel Haberci
16/04/2022
Yerel Haberci
16/04/2022
Yerel Haberci
12/04/2022
Yerel Haberci
10/04/2022
Yerel Haberci
06/04/2022
Yerel Haberci
25/03/2022
Yerel Haberci
21/03/2022
Yerel Haberci
18/03/2022
Yerel Haberci
05/03/2022
Yerel Haberci
03/03/2022
Yerel Haberci
22/02/2022
Yerel Haberci
18/02/2022
Yerel Haberci
18/12/2021
Yerel Haberci
27/11/2021
Yerel Haberci
25/11/2021
Yerel Haberci
17/11/2021
Yerel Haberci
16/11/2021
Yerel Haberci
06/11/2021
Yerel Haberci
05/11/2021
Yerel Haberci
25/10/2021
Yerel Haberci
22/10/2021
Yerel Haberci
22/10/2021
Yerel Haberci
18/10/2021
Yerel Haberci
07/10/2021
Yerel Haberci
03/10/2021
Yerel Haberci
01/10/2021
Yerel Haberci
30/09/2021
Yerel Haberci
30/09/2021
Yerel Haberci
28/09/2021
Yerel Haberci
18/08/2021
Yerel Haberci
18/08/2021
Yerel Haberci
12/08/2021
Yerel Haberci
03/08/2021
Yerel Haberci
17/07/2021
Yerel Haberci
16/07/2021
Yerel Haberci
12/06/2021
Yerel Haberci
09/06/2021
Yerel Haberci
08/06/2021
Yerel Haberci
28/05/2021
Yerel Haberci
27/05/2021
Yerel Haberci
19/05/2021
Yerel Haberci
11/05/2021
Yerel Haberci
11/05/2021
Yerel Haberci
11/05/2021
Yerel Haberci
29/04/2021
Yerel Haberci
17/04/2021
Yerel Haberci
13/04/2021
Yerel Haberci
02/04/2021
Yerel Haberci
01/04/2021
Yerel Haberci
11/03/2021
Yerel Haberci
11/03/2021
Yerel Haberci
09/03/2021
Yerel Haberci
08/03/2021
Yerel Haberci
08/03/2021
Yerel Haberci
08/03/2021
Yerel Haberci
07/03/2021
Yerel Haberci
07/03/2021
Yerel Haberci
07/03/2021
Yerel Haberci
07/03/2021
Yerel Haberci
06/03/2021
Yerel Haberci
28/02/2021
Yerel Haberci
27/02/2021
Yerel Haberci
18/02/2021
Yerel Haberci
28/01/2021
Yerel Haberci
28/01/2021
Yerel Haberci
21/05/2021
Yerel Haberci
21/05/2021
Yerel Haberci
13/01/2021
Yerel Haberci
12/01/2021
Yerel Haberci
20/12/2020
Yerel Haberci
08/01/2021
Yerel Haberci
23/11/2020
Yerel Haberci
01/12/2020
Yerel Haberci
18/11/2020
Yerel Haberci
29/10/2020
Yerel Haberci
26/10/2020
Yerel Haberci
15/10/2020
Yerel Haberci
29/09/2020
Yerel Haberci
28/09/2020
Yerel Haberci
13/09/2020
Yerel Haberci
03/09/2020
Yerel Haberci
14/08/2020
Yerel Haberci
04/08/2020
Yerel Haberci
25/07/2020
Yerel Haberci
19/06/2020
Yerel Haberci
29/05/2020
Yerel Haberci
28/05/2020
Yerel Haberci
18/05/2020
Yerel Haberci
14/05/2020
Yerel Haberci
04/05/2020
Yerel Haberci
04/05/2020
Yerel Haberci
03/05/2020
Yerel Haberci
02/05/2020
Yerel Haberci
26/04/2020
Yerel Haberci
22/04/2020
Yerel Haberci
05/04/2020
Yerel Haberci
23/03/2020
Yerel Haberci
22/03/2020
Yerel Haberci
21/03/2020
Yerel Haberci
04/02/2020
Yerel Haberci
29/01/2020
Yerel Haberci
17/01/2020
Yerel Haberci
10/01/2020
Yerel Haberci
03/01/2020
Yerel Haberci
12/12/2019
Yerel Haberci
07/12/2019
Yerel Haberci
05/12/2019
Yerel Haberci
04/12/2019
Yerel Haberci
Yerel Haberci
28/11/2019
Yerel Haberci
27/11/2019
Yerel Haberci
19/11/2019
Yerel Haberci
11/11/2019
Yerel Haberci
11/11/2019
Yerel Haberci
09/11/2019
Yerel Haberci
07/11/2019
Yerel Haberci
04/11/2019
Yerel Haberci
30/10/2019
Yerel Haberci
18/10/2019
Yerel Haberci
06/05/2019
Yerel Haberci
06/05/2019
Yerel Haberci
28/04/2019
Yerel Haberci
14/04/2019
Yerel Haberci
13/04/2019
Yerel Haberci
08/04/2019
Yerel Haberci
16/03/2019
Yerel Haberci
14/03/2019
Yerel Haberci
27/02/2019
Yerel Haberci
17/10/2018
Yerel Haberci
30/03/2018
Yerel Haberci
15/02/2018